Boc基團和Cbz基團是多肽合成中最常用的兩種氨基保護基，而在固相合成中，氨基的保護多用Boc。
采用逐步縮合定向法以得到具有特定氨基酸順序的多肽，把不需要反應的氨基羧基用基團保護起來，再進行連接反應，保證定向反應的順利進行。 液相法和固相法是多肽合成的主要方法。固相法具有可自動化操作，產物易分離的優勢而被更加廣泛地使用。分為Fmoc和tBoc法，由于前者具有更大優勢，故如今多采用Fmoc法合成。
多肽合成又叫肽鏈合成，是一個固相合成順序一般從C端(羧基端)向N端(氨基端)合成。過去的多肽合成是在溶液中中止的稱為液相合成法。多肽的合成主要分為兩條途徑:化學合成多肽和生物合成多肽。
多肽合成（化學）方法，包括液相和固相兩種方法。液相多肽合成方法現在主要采用BOC和Z兩種保護方法，現在主要應用在短肽合成，如阿斯巴甜，力肽，催產素等，其相對與固相多肽合成，具有保護基選擇多，成本低廉，合成規模容易放大的許多優點。與固相多肽合成比較，液相多肽合成主要缺點是，合成范圍小，一般都集中在10個氨基酸以內的多肽合成，還有合成中需要對中間體進行提純，時間長，工作量大。固相多肽合成方法現在主要采用FMOC和BOC兩種方法，它具有合成方便，迅速，容易實現自動化，而且可以比較容易的合成到30個氨基酸左右多肽。
